Le Pandinus imperator fait partie des plus grands scorpions connus à ce jour. Sa taille adulte est d'environ 20 cm queue comprise. Cela dit, du fait de la raréfaction de l'espèce, on trouve de moins en moins de grands spécimens. Il est de couleur noire avec des reflets verdâtres.
Ses pinces sont larges mais surtout puissantes, elles sont de teinte brunâtre et granuleuses. En introduisant le scorpion dans une boîte transparente, on pourra remarquer par le dessous au niveau de sternite, les peignes.
Ceux du mâle sont nettement plus longs et leurs dents également. Cependant le nombre de dents des peignes ne peut être un critère rigoureux de sexage.